Mal unabhängig, ob hier jemand ein Lösungsvorschlag haben möchte oder nicht!
Es ist schon seltsam das es erhebliche Unterschiede in der Batterieleistungsdauer des Keyfobs gibt 
Bin mittlerweile 11 Monate mit meinem #3 unterwegs und benutze zu 99,9% immer den gleichen Schlüssel...keine Meldung oder Funktionstörungen mit meinem Schlüssel.
Eine Idee wäre:
Das Auto geht selten in den "Schlafmodus" und kommuniziert dadurch ständig den Keyfob und zieht die Batterie des Schlüssels schneller leer.
Ursache für den häufigen Wachmodus könnte wie bei einigen die berühmte
schwache "12V Batterie" sein, die das Auto versucht immer wieder aufzuladen. Dadurch müsste sich aber auch ein leichter Verlust im Stand der H/V Batterie bemerkbar machen.
Ist nur so' ne Theorie von mir, da bei einigen die Keyfob Batterie extrem schnell nachlässt.
Kann man auch mit der SMore# App bei der Batterieanzeige gut kontrollieren.
Die ist bei mir sehr stabil und fällt selten unter 12V.